Présentation du service d’analyse de données

Migale & Vous

Olivier Rué

MaIAGE - Migale

21 mai 2024

Un service “au service” de la communauté

• Service construit et mis en place fin 2015 lors de mon recrutement sur la plateforme
• Mission : répondre aux besoins en bioinformatique et biostatistiques de la communauté du département MICA / INRAE / au-delà
• Intégré aux processus de la plateforme (certifiée ISO9001-2015)
  • procédures / audits
  • exigence (planification, organisation…)

Organisation interne

• Centralisation des rapports d’analyse
• Rapports anonymisés
• Continuité de service en cas d’absence
• Base de connaissances

Nos attentes/exigences

• Continuité avec les formations dispensées ➡️ vers l’autonomie des biologistes
• Respect des principes FAIR
  • reproductibilité, gestion des données…
• Collaborations basées sur l’échange
  • mise à disposition régulière des résultats
  • points réguliers
  • accompagnement jusqu’à la valorisation des résultats
• Sans contre-partie financière pour les académiques ! (hormis stockage dans la limite de notre disponibilité)

Comment demander une analyse ?

• https://migale.inrae.fr/ask-data-analysis
• Détails sur le mode souhaité
• Détails sur les données (estimer le temps nécessaire)
• Délivrables souhaités
• Souhait de date limite de réalisation

Mode 1 : Collaboration

• Nous nous occupons des analyses
• Nous vous préparons un rapport d’analyse
• Nous nous occupons des données (sauvegarde, intégrité…)

Mode 2 : Accompagnement

• Nous vous aidons à réaliser vos analyses
• Nous vous guidons dans le choix des outils / des paramètres
• Nous nous engageons à vous débugger rapidement
• Nous ne récupérons pas les données et ne préparons pas de rapport d’analyse
• Possibilité de vous accueillir sur la plateforme pour vous consacrer pleinement à vos analyses

Évolution 2016-2024

Bilan / métriques

Bilan / métriques

Exemple de rapport

Comme Cassandre, n’hésitez pas à en parler autour de vous et à nous solliciter