Module 25 - 21 mars 2024

Introduction aux bonnes pratiques pour des analyses reproductibles

Contacts

01.34.65.29.74 (Veronique Martin)

formation.migale@inrae.fr

Objectifs pédagogiques

L’objectif de cette formation est d’initier les apprenants aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des analyses. Ils apprendront à rédiger des rapports d’analyse en R Markdown et à les déposer sur un dépôt GitHub. Les principes FAIR (faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables) et les bases de la rédaction de PGD (plans de gestion de données) seront également présentés. Durant la formation, nous utiliserons RStudio et GitHub.

Programme

  • Principes et enjeux de la recherche reproductible
  • Utilisation de GitHub
  • Gestion des versions d’un document
  • Rédaction de document computationnel
  • Partage d’un rapport avec ses collaborateurs
  • Principes FAIR et PGD

Informations pratiques

Dates et Horaires Durée Tarifs (Hors Taxe)
21 mars 2024
9h30-17h00
1 jour(s) 150 € (INRAE)
170 € (Académique)
550 € (Non académique)
Modalités de paiement Conditions d’annulation
Uniquement par bon de commande En l’absence d’annulation par mail
avant le 06 mars 2024,
le paiement sera dû
Lieu Plan et Moyen d’accès
Centre INRAE Jouy-en-Josas
Unité MalAGE
Bât. 233

https://migale.inrae.fr/how-to-come

Intervenants

Cédric Midoux / Valentin Loux


A work by Migale Bioinformatics Facility
Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France
Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France