Migale documents

Tutorials

Communication

Dans les coulisses de Migale #8

3 min

Migale team

5/21/24

Dans les coulisses de Migale #7

5 min

Migale team

3/20/24

Dans les coulisses de Migale #6

4 min

Migale team

1/11/24

Dans les coulisses de Migale #5

3 min

Migale team

12/21/23

Dans les coulisses de Migale #4

4 min

Migale team

9/25/23

Dans les coulisses de Migale #3

4 min

Migale team

7/5/23

Dans les coulisses de Migale #2

5 min

Migale team

3/10/23

Dans les coulisses de Migale #1

3 min

Migale team

1/25/23

Documentation Migale

Tools

All you have to know about the command line tools Migale provide

Databanks

All you have to know about the databanks Migale provide

FAQ

You will find here frequently asked questions, organized by thematics

Publications

You will find publications where Migale is involved

Training materials

Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

Module 8 bis

NGS

galaxy

Cédric Midoux, Valentin Loux

4/23/24

Introduction to the tidyverse

Module 12ter

Mahendra Mariadassou, Christelle Hennequet-Antier

4/2/24

Introduction aux bonnes pratiques pour des analyses reproductibles

Cédric Midoux, Valentin Loux

3/21/24

Analyse de données métagénomiques shotgun

Module 24

command line

metagenomics

Cédric Midoux, Olivier Rué, Valentin Loux

3/18/24

Analyse de données de métabarcoding

Module 20

galaxy

metagenomics

Olivier Rué, Mahendra Mariadassou, Cédric Midoux

9/11/23

Introduction to the tidyverse

Module 12

Mahendra Mariadassou, Christelle Hennequet-Antier

6/19/23

Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

Module 8 bis

NGS

galaxy

Cédric Midoux, Valentin Loux

6/15/23

Analyse de données métagénomiques shotgun

Module 24

command line

metagenomics

Cédric Midoux, Olivier Rué, Valentin Loux

6/5/23

Introduction à Galaxy

Module 17

Galaxy

Mouhamadou Ba, Sylvain Marthey

3/23/23

Développement d’application Shiny

Module 26

shiny

Cédric Midoux, Mahendra Mariadassou, Sandra Dérozier

3/20/23

Presentations

MetaPDOCheese

Étude métaomique des fromages AOP français

Mahendra Mariadassou, Celine Delbes, Françoise Irlinger, Many people

11/6/24

Présentation du service d’analyse de données

Migale & Vous

Olivier Rué

5/21/24

Comparison of metabarcoding taxonomic markers to describe fungal communities in fermented foods

METABARFOOD project

Olivier Rué

12/4/23

Plateforme Migale

Visite départements MICA/MathNum

Valentin Loux, Olivier Rué

9/27/23

Analyse de données métagénomiques 16S - FROGS

Master BMC - Atelier Biodiversité microbienne

Olivier Rué

9/22/23

Packages R pour controler son travail et ainsi mieux optimiser, réutiliser et communiquer autour de ses analyses

Journées du PEPI IBIS 2023

renv

targets

Quarto

Cédric Midoux, Philippe Ruiz

9/15/23

The wonderful world of OpenScience

Séminaire Scientifique et Technique de l’UR PROSE

Quarto

Club Bioinfo, Jouy

Quarto

Mahendra Mariadassou, Cédric Midoux

4/13/23

A work by Migale Bioinformatics Facility
Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France
Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France

Categories

Tutorials

RNA-seq transcriptome analysis

Metabarcoding analysis (16S rRNA marker) with FROGS 5.0.0 in command line

Create your own FROGS databank

L’infrastructure de Migale

Analyser la qualité des données de séquençage Illumina

16S Metagenomics - Ravel dataset analysis

Metabarcoding analaysis (16S rRNA marker) with FROGS 4.1.0 in command line

16S Metagenomics - Chaillou dataset analysis

Initiation à R

Communication

Dans les coulisses de Migale #8

Dans les coulisses de Migale #7

Dans les coulisses de Migale #6

Dans les coulisses de Migale #5

Dans les coulisses de Migale #4

Dans les coulisses de Migale #3

Dans les coulisses de Migale #2

Dans les coulisses de Migale #1

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Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy

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Comparison of metabarcoding taxonomic markers to describe fungal communities in fermented foods

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