Dans les coulisses de Migale #6

Chers utilisateurs et utilisatrices,

L’ensemble de l’équipe vous présente ses meilleurs vœux pour l’année 2024.

Voici quelques nouvelles et événements que nous souhaitons partager avec vous sans plus tarder.

Démarche qualité

Pour rappel, notre questionnaire de satisfaction annuel est toujours en cours. Nous encourageons tous nos utilisateurs à remplir le questionnaire de satisfaction. Ce questionnaire est un élément important de notre politique qualité et est un des moyens que nous utilisons pour avoir votre retour sur les services que nous vous proposons. Merci de le remplir avant le 15 janvier 2024 afin de pouvoir en tenir compte lors de notre revue de direction prévue le 18 janvier.

Infrastructure et sécurité informatique

Vous avez peut-être rencontré des soucis de connexion à Migale (front, Galaxy, Rstudio) durant la période de fin d’année ?

Suite à un incident majeur de cybersécurité, l’ensemble des sites web INRAE ont été totalement inaccessibles entre le 22 et le 27 décembre, puis accessibles uniquement aux heures ouvrées en semaine entre le 28 décembre et le 8 janvier.

En dehors des coupures d’accès à l’ensemble des services, dont nous sommes désolés, il n’y a pas eu d’impact sur vos données ou sur les calculs en cours. Quelques problèmes de connexions ont pu être constatés début janvier mais ont été résolus.

Pour les utilisateurs INRAE de notre plateforme, nous vous demandons de suivre les directives émises par la DSI INRAE de changement de mot de passe institutionnel et de faire de même avec votre compte Migale avant le 29 janvier. Vous trouverez sur notre site web, rubrique FAQ, un paragraphe « How to change my password » qui reprend la procédure de changement de mot de passe.

De manière générale, nous vous incitons fortement à suivre les recommandations émises par votre institut (ici pour INRAE) ou les services de l’état concernant la gestion des mots de passe (mots de passe différents pour les différents services, utilisation de mots de passe longs et complexes, utilisation d’un gestionnaire de mot de passe, …). Vous trouverez sur cette page du site cybermalveillance.gouv.fr un ensemble de recommandations et de propositions d’outils pour les mettre en œuvre.

Communication

Nous avons le plaisir de vous proposer une nouvelle rencontre en ligne, intitulée « Migale & vous » pour échanger autour des activités de la plateforme. Ces rencontres régulières sont destinées aux utilisateurs de la plateforme intéressés pour (re-)découvrir ou discuter autour des offres de service de la plateforme.

Pour la 2e édition, nous vous présenterons un rapide bilan des activités 2023 de la plateforme. Nous ferons ensuite un focus sur le projet « Ferments du Futur » avec une présentation de projet par Damien Paineau, directeur exécutif, suivie d’un exposé sur le positionnement de la plateforme dans le projet. Enfin, nous évoquerons les projets et perspectives de Migale. Ce sera par ailleurs l’occasion pour vous de poser vos questions et d’échanger avec toute l’équipe.

Migalez-vous le jeudi 25 janvier de 14h à 15h15 via ce lien !

Programme :

• Le bilan des activités 2023 de la plateforme
• Un focus sur le projet Ferments du Futur avec la participation de Damien Paineau (directeur exécutif de Ferments du Futur)
• Les projets et perspectives de la plateforme
• Posez-nous toutes vos questions

Formations

Migale vient d’ouvrir son cycle 2024 de formation “Bioinformatique par la pratique” avec 18 modules dont un en anglais :

• Introduction aux bonnes pratiques (git, PGD, FAIR, …) pour des analyses reproductibles
• Initiation à l’utilisation de Galaxy
• Analyse primaire de données issues de séquenceurs nouvelle génération sous Galaxy
• Traitement bioinformatique et analyse différentielle de données d’expression RNA-seq sous Galaxy
• Analyse statistique de données RNA-Seq -Recherche des régions d’intérêt différentiellement exprimées (R, RStudio)
• Analyse de données de métabarcoding
• Analyse de données métagénomiques «shotgun»
• Comparaison de génomes microbiens
• Initiation au langage R et (Introduction to the R language)
• Graphiques sous R avec ggplot2
• Manipulation de données avec R : introduction à tidyverse
• Développement d’une application avec R Shiny
• Python : Initiation et Avancé
• Initiation à Linux
• Introduction au text-mining avec AlvisNLP
• Modélisation in silico de structures 3D de protéines. Prédiction de mutations, de fixation de ligands

Toutes les informations se trouvent sur https://documents.migale.inrae.fr/trainings.html

Migalement vôtre,

L’équipe