Dans les coulisses de Migale #9

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Auteur·rice

Migale team

Date de publication

4 novembre 2024

Chers utilisatrices et utilisateurs,

Voici quelques nouvelles et événements que nous souhaitons partager avec vous sans plus tarder.

Communication

Le prochain webinaire “Migale & Vous” aura lieu jeudi 7 novembre de 14h à 15h sur ce lien zoom ; ces rencontres régulières sont destinées aux utilisateurs de la plateforme intéressés pour (re-)découvrir ou discuter autour des offres de service de la plateforme. Pour cette 4e édition, nous accueillerons également Françoise Irlinger, Mahendra Mariadassou et Céline Delbès : ils nous présenteront les résultats obtenus dans le cadre du projet MetaPDOcheese qui constitue une analyse de grande ampleur sur la diversité microbienne des laits et fromages AOP, en lien avec les pratiques de production. Pour en savoir plus, connectez-vous jeudi 7 novembre de 14h à 15h ;)

La plateforme a mis à jour son catalogue de services sur son site web ; n’hésitez pas à aller le consulter.

Ressources humaines

Le profil de poste en bioinformatique ouvert par MICA à la mobilité n’a malheureusement pas été pourvu. Nous venons par contre d’accueillir Manon Connault qui a été recrutée par l’UMS IFB-Core sur un profil IE DevOps ; elle consacrera 20% de son temps sur des activités Migale.

Gestion des comptes et données

À l’occasion de la demande de renouvellement de son label d’Infrastructure Scientifique Collective d’INRAE, Migale a retravaillé sa charte d’utilisation. Nous vous invitons à en prendre connaissance au plus vite, et revenons ici sur quelques points très importants :

  • Migale ne peut être utilisée pour stocker et analyser des données personnelles et des données de santé.
  • Les comptes sont strictement personnels et ne peuvent pas être partagés ; de la même façon, l’utilisateur est responsable des droits associés à ses données.
  • Les comptes inactifs durant une année sont supprimés et les données associées effacées. Les utilisateurs qui changent de labo, d’employeurs ou de statut doivent impérativement en informer la plateforme afin de régulariser leur compte.
  • En aucun cas, la plateforme ne pourra donner accès à des données autrement qu’à son-sa propriétaire ; il convient donc d’anticiper en cas de départ d’un personnel.
  • Seules les données stockées dans les espaces ‘save’ et ‘home’ sont sauvegardées chaque jour avec une durée de rétention de 7 jours seulement. Aucun backup n’existe pour Galaxy et l’espace ‘work’. Il est donc de la responsabilité de l’utilisateur de faire une sauvegarde dédiée.

Nous en profitons pour rappeler que l’utilisation de la plateforme doit être citée dans les publications et communications orales.

De plus, le Plan de Gestion de Données d’Entité de la plateforme Migale est désormais disponible sur l’entrepôt Recherche Data Gouv ; n’hésitez pas à vous appuyer dessus pour vos PGD de projets.

Formations

Le cycle de formation 2025 sera publié sur le site de la plateforme dès le 5 janvier. Tous les modules 2024 seront reconduits, y compris celui sur l’analyse de données metabarcoding qui avait fait une pause en 2024. Si vous êtes intéressés, surveillez le site web de la plateforme ou abonnez-vous à la mailing liste.

Pour nous rencontrer

Nous serons présents aux journées des IR INRAE (5-6 nov, Paris), au colloque Labos-1point5 (5-7 nov, Paris), aux Rencontres des Référents Données Opérationnels (19-21 nov, Sète), à l’AG CNOC (27-28 nov, Avignon), au Hackathon inter-CATI Omics (9-12 décembre, Sète), à l’AG IFB (11-13 déc, Paris).

Migalement vôtre,

L’équipe


A work by Migale Bioinformatics Facility
Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France
Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France