Introduction aux bonnes pratiques pour des analyses reproductibles

Module 25

L’objectif de cette formation est d’initier les apprenants aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des analyses. Ils apprendront à rédiger des rapports d’analyse en R Markdown et à les déposer sur un dépôt GitHub. Les principes FAIR seront également présentés. Durant la formation, nous utiliserons RStudio et GitHub

Auteur·rice·s

Affiliations

Cédric Midoux

PROSE & MaIAGE - Migale

Valentin Loux

MaIAGE - Migale

Plaquette

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Prérequis

Aucun prérequis n’est nécessaire.

Supports

• Slides
• TP

Programme

• 9h30 - 10h : Introduction et tour de table
• 10h - 11h : Crise de la reproductibilité
• 11h - 12h30 : Versionner ses documents
• 13h30 - 15h : Documents computationels
• 15h - 16h30 : Aller vers le FAIR
• 16h30 - 17h : Discussion et ouverture

Compléments

• Check-list pour des bonnes pratiques de gestion des données de recherche

Réutilisation