Module 25 - 4 avril 2025

Introduction aux bonnes pratiques pour des analyses reproductibles

Théorie 20 % - Pratique 80 % - 10 stagiaires par session1 - 1 poste informatique par stagiaire

Contacts

01.34.65.29.74 (Veronique Martin)

formation.migale@inrae.fr

Objectifs pédagogiques

L’objectif de cette formation est d’initier les apprenants aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des analyses. Ils apprendront à rédiger des rapports d’analyse en R Markdown et à les déposer sur un dépôt GitHub. Les principes FAIR (faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables) et les bases de la rédaction de PGD (plans de gestion de données) seront également présentés. Durant la formation, nous utiliserons RStudio et GitHub.

Programme

  • Principes et enjeux de la recherche reproductible
  • Utilisation de GitHub
  • Gestion des versions d’un document
  • Rédaction de document computationnel
  • Partage d’un rapport avec ses collaborateurs
  • Principes FAIR et PGD

Informations pratiques

Dates et horaires

Jours

Tarifs

4 avril 2025

1 jour(s)

150 € (INRAE)

9h00-17h00

170 € (Académique)

550 € (Non académique)

Modalités de paiement

Conditions d'annulation

Uniquement par bon de commande

En l'absence d'annulation par mail avant le

20 mars 2025

le paiement sera dû

Intervenants

Cédric Midoux / Valentin Loux

Notes de bas de page

  1. -Nous nous réservons le droit d’annuler ce module si le nombre de participants est inférieur à 5-↩︎


A work by Migale Bioinformatics Facility
Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France
Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France